Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms