Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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IKZF1Q13422 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IKZF1Q13422 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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