Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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