Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms