Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSME1Q06323 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms