Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ID3Q02535 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ID3Q02535 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms