Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BACE1P56817 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BACE1P56817 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BACE1P56817 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms