Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms