Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms