Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms