Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTHFRP42898 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTHFRP42898 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTHFRP42898 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms