Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms