Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms