Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRCP23327 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRCP23327 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HRCP23327 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HRCP23327 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HRCP23327 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HRCP23327 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRCP23327 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRCP23327 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms