Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LBPP18428 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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LBPP18428 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LBPP18428 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LBPP18428 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LBPP18428 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LBPP18428 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LBPP18428 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LBPP18428 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LBPP18428 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LBPP18428 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LBPP18428 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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