Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms