Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms