Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RALAP11233 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RALAP11233 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms