Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms