Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COCHO43405 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COCHO43405 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COCHO43405 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms