Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSI1O43347 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSI1O43347 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSI1O43347 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms