Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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