Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP23O00161 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms