Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF879B4DU55 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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