Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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