Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBA1A5PL33 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms