Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms