Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms