Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH3Q9UHC1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms