Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms