Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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