Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms