Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms