Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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