Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms