Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CINPQ9BW66 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms