Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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