Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms