Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms