Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EYA3Q99504 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms