Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN18Q96SJ8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms