Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms