Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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