Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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