Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2Q8WZ74 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms