Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms