Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP3Q8WYN3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP3Q8WYN3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms