Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms