Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PARP9Q8IXQ6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms