Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC021087.3-201ENST00000565521 2881 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms